Дата основания - 1973 год. Музей медицины сразу же расположился в историческом здании 19-го века (построено в 1853 году по проекту архитектора Беретти), в котором ранее находился анатомический музей Киевского университета.

Директор музея - Вадим Шипулин, профессор, доктор медицинских наук, заслуженный врач Украины.

Интересные факты: 

• В музее представлено развитие медицины на территории современной Украины с древнейших времён до наших дней.
• В основу организации музея была положена новейшая концепция музееведения, которая позволила использовать научно-методические и документальные материалы и экспонаты в комплексе с архитектурными, художественно-техническими и аудио-визуальными средствами.
• Музей медицины Украины является одним из самых больших медицинских музеев в Европе.
• Кроме стендовой экспозиции в музее созданы оригинальные интерьеры (операционной, кабинетов профессоров медицины, аптеки), с портретными фигурами известных учёных и врачей (Пирогов, Образцов, Заболотный), а также впечатляющие диорамы "Медицинская помощь в войске Богдана Хмельницкого", "Медицинская помощь защитникам Киева, август 1941 г." и "В полковом медицинском пункте".
• Особый интерес представляет натурный интерьер бани времен Киевской Руси (Х-ХІ век), которые использовались не только в гигиенических, но и в лечебных целях.
• Отдельные экспозиции посвящены трагическим страницам нашего прошлого и роли врачей в нем - голодомор 1932-33 годов, сталинские репрессии, Чернобыльская катастрофа.
• Музей медицины являлся инициатором создания первого историко-медицинского журнала "Агапит", в котором публикуются не только украинские, но и зарубежные авторы.